皇帝再次南巡時，召集一群以歌妓水沐萍為首的風塵女子在西湖上夜夜笙歌。魏嬿婉不懷好意告知如懿，皇帝召幸風塵女子的消息，使如懿怒登御舟。
如懿因為勸阻乾隆不成，一怒剪發，從此二人也就徹底決裂。被乾隆先行送回京師，并裁剪宮人吃穿用度，翊坤宮形同冷宮。因斷發忤逆，皇帝奪其皇后、皇貴妃、貴妃、妃四份冊寶，圈禁。形同廢后。幽禁翊坤宮不久患上癆癥，命不久矣。
永琪凸顯才華能力，封為榮親王，魏嬿婉為防止如懿東山再起，授意胡氏暗害永琪，使永琪得上附骨疽之證。永琪臨終之前，向如懿坦白一切，卻被趕來的皇帝聽見，加之胡氏進見讒言，誤會如懿因為凌云徹一事疏遠永琪，使得永琪避嫌不用如懿的太醫，最終病入膏肓。
如懿久病纏身，終拔刀自盡，容佩殉主而亡，以皇貴妃之禮入葬妃陵。喪儀由愉妃、穎妃打理，同時晉容嬪（寒香見）為妃，與愉妃一起撫育永璂。魏嬿婉因如懿死前故作炫耀，被如懿以自盡方式陷害，被穎妃和七公主撞見，從而被皇帝懷疑。如懿死后，海蘭與穎妃等蒙古嬪妃結盟，并且伙同寒香見，婉嬪一同搜集罪證告發了衛嬿婉，衛嬿婉最終被賜死。
《如懿傳》大結局最后，皇帝在如懿死后的十年一直緬懷如懿。剩下的妃嬪也都相安無事的活在后宮之中。如懿可以說是史上最慘、最可憐的人設了，不僅僅被心愛的男人厭惡、虐慘，在病中慘死的如懿只有十二阿哥一個牽掛，但結果還是——如懿的孩子都死了，令人感嘆不已。