宗介是一個普通的小男孩，波妞是藤本和曼瑪蓮的女兒，偷偷離家后，不小心被困在玻璃瓶里，不能自由，后來她被宗介救下，當時宗介不知道這條小魚的名字，所以便給他取名為宗介，而波妞是一條神奇的魚兒，在她添了宗介的血液后，她瞬間長成小孩的模樣，還對宗介說：波妞喜歡宗介。
后來，波妞來到宗介的家里，每天和宗介朝夕相處。波妞超級喜歡吃火腿，每當宗介遇到任何難題的時候，波妞都會幫助他，直到有一天，波妞的爸爸媽媽要帶她走，因此兩人分離。
不過，這部動漫的結局是好的，波妞的父母愿意讓波妞和宗介一起相處，所以波妞和宗介最終又重新相聚。波妞為了宗介付出許多努力，她想習慣宗介的生活方式，于是開始學著使用筷子吃飯，兩人的友誼感動了許多人。