快斗發現了一個神秘的組織，是這個組織殺害了他的父親。他們在搜集一個可以延長生命的寶石，傳說這塊寶石在月光下，就能知道是否有潘多拉。快斗和他的父親一樣，開始尋找所有的寶石，發現后他們會去偷，再會去排查尋找來的寶石里面有沒有潘多拉。而工藤新一在一次某個組織中被試了藥物，從此與那個組織展開了爭斗。
魔術快斗和名偵探柯南兩者中的男主角長相非常相似，女主角的長相也非常相似，而且都是從小青梅竹馬長大的，都是互相的喜歡著。在一些細節上都為男主的破案提供了線索，女主都是個愛八卦的人，一直推動著男女主角情感的發展。
《魔術快斗》和《名偵探柯南》都是講述著日常生活中發生的案件。這兩部作品各有各的角度，工藤新一總是用智慧閃爍著他的光芒，他像黑暗中指明著方向的星星。黑羽快斗更像是神秘華麗的寶石。