第一次下落不明的時候藍曦臣才20歲，岐山溫氏逼姑蘇藍氏自燒仙府，毀掉所有藏書，說藍家的藏書大逆不道，藍家反抗但云深不知處還是被燒了。
藍曦臣作為長子肩負重任，帶著藍家藏書出逃，等這件事告一段落后再把藏書帶回藍家。但當時藍曦臣帶著書又被人追殺，逃亡之旅十分艱難，和家人失去聯系下落不明，后來被還沒改名的金光瑤救了一命，安然回到姑蘇藍家。
第二次下落不明是二次圍剿亂葬崗失敗后，陰謀敗露的金光瑤打算逃走，挾持了藍曦臣，裝出一副自己和藍曦臣被襲擊閉關修養的樣子，但實際上把藍曦臣帶去了觀音廟，最后金光瑤死在了觀音廟，藍曦臣獲救回到藍家。