可以說知道柯南身份的人真的不少，除了阿笠博士之外，灰原哀、柯南的父母、服部平次、怪盜基德等人都知道柯南就是工藤新一，唯獨片中的其他重要角色，例如小蘭、毛利小五郎、偵探少年團等人并不知道柯南的真實身份。
對于柯南為什么不透露身份，很大一部分原因是在于想要保護身邊的人，因為他的身份還是越少人知道越好，否則周邊人會遭到黑暗組織的追殺等。
不過柯南曾經有過想要對小蘭透漏身份的時候，尤其是在1999年的劇場版《世紀末的魔術師》中，小蘭多次懷疑柯南，柯南覺得瞞不下去了，在即將摘下眼鏡的時候，怪盜基德化身為工藤新一，幫助柯南解了圍。
并且怪盜基德還說了一句：“這世上有些事情，最好讓它永遠成謎比較好。”