動漫中，皮卡丘就是有毛的，有一些劇情是凸顯了“有毛”這個設定的，不過展現的次數不多，所以大家容易造成誤解。其實，如果細心一點不難發現，小智撫摸皮卡丘的時候，被撫摸的部位有一些小小的凹陷。
皮卡丘是外形十分有特點的寶可夢，它全身長著黃色的短毛，有一張圓圓的臉蛋，臉頰上有一團紅色的毛。它還有兩只尖尖的的耳朵，耳朵最上端呈黑色。皮卡丘的尾巴呈閃電狀，算是對它技能的暗示。
不少人都曾對皮卡丘的原型產生懷疑，大眾的推測從倉鼠，花栗鼠，龍貓，兔子等動物形象身上猜了個遍，不過都沒有答對的。皮卡丘設計者西田敦子曾公開表示：“皮卡丘的靈感是基于一只松鼠而非老鼠”。
松鼠就是毛茸茸的，皮卡丘又怎么會沒有毛呢。比較有意思的是，皮卡丘的原型雖然不是老鼠，可它還是被劃分到鼠寶可夢里邊去了，這算是一個冷知識哦。