化妝刷在使用時會沾取大量的彩妝產品，這些不同顏色的彩妝產品時間久了就會污染化妝刷。化妝刷長時間被這些化妝品的污垢包圍，很容易滋生細菌產生很多有害物質。如果在繼續使用未清潔干凈的化妝刷，就會對上妝部位的皮膚造成一定的傷害。
化妝刷中的殘留化妝品大多都含有油脂類的物質。因此用普通的洗面奶或者是洗滌液是無法徹底清洗干凈的。可以用皂角類的洗面奶或者是堿性的洗發水來洗滌化妝刷。化妝品中的油脂是溶于堿性溶液的，所以能夠輕松的將化妝刷中的殘留物清洗干凈。
化妝刷在清洗干凈之后，應當用干凈的紙巾包住刷毛將多余的水分吸干拭去。然后再將化妝刷放在一個溫度適宜、比較陰涼干燥的地方晾干。千萬不要急于求成讓化妝刷在太陽底下曝曬，也不要用吹風機的熱風直接吹干化妝刷頭。這些方法都會導致化妝刷的刷毛變形脫落，會影響到下一次的繼續使用效果。