但是存儲的溫度也不能過低，因為過低的溫度會將手工皂凍開裂，而過高的溫度又會導致其中會滋生細菌或者融化，所以手工皂的存儲是一個大問題，手工皂如果保存得當那么可以保存半年以上甚至1~2年，如果其中添加了各種精油那么它的期限就會比較短暫，如果其中還添加了牛奶或者其他的水果類成分，那么保質期就會比其他的皂更短最好半年內用完。
手工皂在空氣中會吸收很多水分，它的吸水性能很強所以也很容易變質，所以手工皂的腐敗速度是非常快的，所以可以在溫度和濕度相對適宜的環境下來存儲，如果想要提高手工皂的穩定性那么其中就要加入油脂成分進行皂化，這樣的手工皂才會更耐存儲。
如果遇到空氣濕度較大的陰雨天，手工皂里面可能就會悶出很多的水珠或者手工皂的表面整個變得很潮濕甚至粘膩，所以這時更加要注重干燥和通風不要密封在一個小環境里。