葉青從18歲就開始跟著葉昭南征北戰，與她一起出生入死，本以為將軍是個男人，可是奈何自己對將軍的情感太深，甚至懷疑自己有“斷袖之癖”，他一直在苦苦壓抑著對將軍的情感，在葉青發現將軍葉昭本是女兒身的時候可以說是欣喜若狂，對將軍這么多年的情感一股腦兒的涌出來，讓他招架不住了。
本來以為葉昭將軍是女兒身，他就可以有機會了，可奈何卻得知將軍被指婚給了郡王。本想成人之美，成全將軍和郡王的。可奈何郡王卻并不喜歡葉昭將軍，讓葉青左右為難。最后經過重重磨難，最終抱得美人歸，和葉昭的大侍女秋水走到了一起。
《將軍在上》是一部輕喜劇，用喜劇加戰爭的形式來表現的一部電視劇，這部劇是由小說《將軍在上我在下》改編的，原著本有大量的粉絲，大家都在為劇版捏一把汗，怕演不出將軍葉昭的巾幗之姿，所幸最后敲定女主為金馬影后馬思純，她的精彩演繹也給書粉們上交了一份滿意的答卷。