草雉劍一開始在大蛇丸手里, 這把劍在大蛇丸手里并沒有發光發熱，而是到了佐助的手里才大放異彩，佐助甚至靠草雉劍打敗了團藏。佐助的草雉劍并不長，但是與絕大多數忍者的武器相比，草雉劍已經算長的了。
除了草稚劍之外，佐助還擁有永恒萬花筒寫輪眼。永恒萬花筒寫輪眼，其實就是佐助的眼睛，佐助的眼睛就是他自己的武器。他的眼睛噴射出來的黑炎，有不燃盡一切絕不罷休的恐怖。
除了這兩種武器之外，佐助還擁有輪回眼。因為佐助得到了六道之力，所以他其中一只永恒萬花筒寫輪眼進化成了輪回眼，輪回眼比寫輪眼更為厲害，成為佐助最終極的武器。
佐助的頭腦是他最厲害的武器。無論有多么厲害的武器，沒有一個聰明的頭腦都是白搭，佐助正是因為擁有厲害的武器，又擁有聰明的頭腦，才能夠戰無不勝。比如說他知道自己查克拉不多于是努力修煉劍術以及體術來彌補自己的不足。他知道團藏過分依賴伊邪那歧，所以他就施展了小小的幻術，給了團藏致命的一擊。