《九州牧云記》是一個奇幻的世界，這個世界上有人族，還有魅族和河絡族，蛟族和羽族，還有一個夸父族。這個世界上最大的王朝是端朝，端朝皇上牧云勤和魅族銀容相愛，生下了半人半魅的牧云笙。剛出生的時候，慕容勝被預言說他的出現會亂世。
牧云笙一直被囚禁在宮中，過著悠閑自在，無欲無求的日子，本以為一切都相安無事。知道牧云笙遇到了海圣魅盼兮，相愛相知，牧云笙和心尖上的愛人盼兮還是被迫分開。原本在乎所有人命運的牧云笙，不再無欲無求，本以為按照不改變命運就可以保護所有人，牧云笙卻連自己最心愛的人保護不了，才發現之前的做法太矯情，直接起事造反。
穆如寒江他是端朝掌管軍權的穆如世家的孩子，但一出生，預言家就說他將會是帝王，嚇得他爹穆如槊從小就把他扔了。也正是這個預言，讓慕容寒江養成了好斗勇的性格。牧云笙和穆如寒江本不信命，試圖擺脫命運，卻離命運越來越近。