《心靈法醫》這部劇改編自小說《聽尸》。這部劇主要講述了法醫明川與刑警隊隊長羅筆芯兩人一起搭檔破案的故事。明川被人們稱為“聽尸者”，他是鵬海市著名的法醫，他不僅可以從人的尸體上尋到一些線索，還總是能根據超準的直覺得出與真相相近的推測。羅筆芯是雷厲風行的刑警隊女隊長。她是個盡職盡責的好警察，破獲過許多案件。后來明川和羅筆芯兩人合作辦案，在查案的過程中互相幫助并且成為了很好的搭檔。
第十五集的劇情中，羅筆芯對明川徹底改觀，終于對他敞開了心扉。而明川對羅筆芯的感情也悄悄發生著變化。當羅筆芯即將被調走，明川是舍不得的，他不希望羅筆芯離開。之后鐘局宣布說羅筆芯可以暫緩調離，明川得知這件事的第一反應就是感到高興。其實明川在不知不覺中已經喜歡上羅筆芯，只不過此時的他沒有察覺。
而到了第十八集，羅筆芯的帥哥朋友秦羽出現了。秦羽和明川是同行，他與羅筆芯的關系十分親密。
有一天羅筆芯下班被秦羽約了出去，在電梯里秦羽把羅筆芯抵在墻上正準備吻她。此時明川正好路過撞見了，于是明川感到吃醋了。到了故事結局，明川向羅筆芯求婚，他們在經歷了很多事后終于如愿走到了一起。