化妝刷每次使用的時候都要跟不用類型的化妝品打交道，有的是粉質，有的是液體，使用完之后，化妝刷都會變臟，如果只是使用卸妝水的話，最多只能夠把化妝刷結塊的部分給化開，但達不到清潔效果（如果是動物毛制成的刷子，不要用卸妝水清洗），所以必須使用專用的化妝刷清洗劑，或者是用嬰兒專用的洗發液。
清洗化妝刷的時候，把清洗劑倒在手心，然后用化妝刷子在手心上不斷打圈，一直到化妝刷干凈為止。如果是動物毛的化妝刷，不要隨隨便便用普通的洗發液或者是沐浴露清洗，這樣可能會傷害到刷毛，甚至還有可能出現刷毛變硬的情況。
市面上也有賣一種類似搓衣板的清洗彩妝刷的工具，這種東西能夠代替掌心，讓化妝刷在上面摩擦，以便去掉殘留的彩妝。化妝刷在晾曬的時候，不要直接放在太陽底下暴曬，這樣會影響化妝刷的使用壽命，也不要用吹風機把化妝刷吹干。