第一種方法是將睫毛刷放到溫水里浸泡一會，要泡到刷子上的睫毛膏變軟，刷毛也有軟化跡象，然后用化妝棉蘸取卸妝水輕輕擦拭，睫毛刷被擦干凈后用清水沖洗，放到陰涼干燥的地方風干。
第二種是用濕紙巾包裹住睫毛刷，等待大約十五分鐘左右，要等到濕紙巾完全陰濕睫毛刷才能打開，然后用濕紙巾輕輕擦拭刷頭，擦干凈后用清水沖洗干凈，放到陰涼干燥的地方晾干。
第三種方法是用洗潔精，同樣先將睫毛刷放到溫水里浸泡，大約十五分鐘后，用手蘸取洗潔精，輕輕擦拭睫毛刷，洗干凈后用清水沖洗，放到陰涼干燥的地方風干，切記陽光暴曬，否則刷頭會變硬。
睫毛膏開封后保質期最多五個月，使用的時候睫毛膏刷了眼睫毛還會回到睫毛膏中，反復數次后會滋生細菌，定期清洗睫毛刷可以減少細菌污染，保證眼部健康。