在西游記中，菩提老祖和如來佛祖是混鯤祖師的徒弟，菩提老祖和如來佛祖一起創立了西方教，擔任代小教主。大弟子最終成為釋迦牟尼佛祖，創立了佛教，二弟子準提道人轉世成為了菩提老祖。
西游中的孫悟空原始一個潑猴，在孫悟空大鬧天空的時候，本性過于頑劣，而菩提佛祖是孫悟空的師傅，他教會了孫悟空一身的本領，教會之后便云游四方了。
菩提老祖深知孫悟空魔性向善的轉化十分困難，可以說是，教會了他本領甚至有些后悔，而后來菩提老祖便關門不再招收弟子，就是怕像孫悟空這樣的徒弟出現。
孫悟空給如來佛祖添了不少的麻煩，而他又是如來佛祖的師弟，在當時如來佛祖都已制服不了孫悟空，便想請師弟幫忙，而菩提老祖不想趟這趟渾水，便隱居起來了。