眼線筆的材質要比眉筆軟得多，因為眼線筆接觸的是眼部皮膚，而眼部皮膚是整個面部皮膚中最為脆弱的部分，所以眼線筆所用到的材質都是比較柔軟的，但是眉筆是用于修飾眉毛的，材質比較硬，所以兩者之間不通用。
眼線筆的筆頭/刷頭都是比較軟的，還是跟它要在眼部皮膚畫線有關系。而且眼線筆的筆頭/刷頭也比較細，畫出來的線條也很流暢。而眉筆的筆頭一般都比較粗，有的眉筆的筆頭還是寬的，為了貼合使用者的眉毛而設定的，所以眉筆沒有辦法來畫眼線，也不適合。
有人會認為眉筆雖然不能夠拿來畫眼線，但是眼線筆能夠拿來畫眉毛吧，其實這個想法也是錯誤的，無論是彩鉛式的眼線筆或者是液體眼線筆，它們的目的都是為了放大雙眼，所以顏色都會比較深，但是畫眉追求的是自然，最好是貼合膚色，用深顏色來畫眉，容易變成“蠟筆小新眉”。