最主要的區別是真假sk2神仙水兩個logo的區別，正品的sk2神仙水logo顏色是比較深的，瓶子顏色也會比假的sk2神仙水顏色更深一點。假的sk2神仙水logo是比較淺的，并且是非常容易脫落的。
但是sk2神仙水液體的顏色不能夠作為真假鑒別的依據，因為sk2神仙水是通過酵母發酵而成的，所以每一瓶的發酵結果不可能是一模一樣的，每一瓶的顏色應該是有細微的差別，但是正品的味道一定是一樣的。
另外還可以看sk2神仙水的標簽，如果是國外生產的，在中國買的會有中文標簽，在大陸的版本是簡體中文的標簽，在臺灣版本是繁體中文的標簽。從標簽上來看正品和假的也是不一樣的，在瓶蓋上真品是沒有標簽的。
另外還可以看sk2神仙水的質感，輕輕搖晃然后把sk2神仙水倒置在桌面上，正品會出現大小不一的泡沫，浮在上面。